一个女人来到小五郎处，请其帮助看守宝石。这女人名叫牧树里，是代表着日本的女演员。她收到预告称有人将会去夺取她所拥有的宝石“命运的宝石”，而预告者正是怪盗基德。小五郎断言：基德将会在树里担任主角的传统话剧的公演最后一天前来盗宝。于是第二天，柯南，小五郎，小兰还有少年侦探团一起前往传统话剧公演的东京汐留。柯南对小五郎的推理充满疑问，于是自己推理基德的出现。然而，在那里出现的竟是工藤新一！

《披荆斩棘3 公演Reaction》是《披荆斩棘 第三季》会员定制衍生节目，每期邀请不同观众、与两位总监和哥哥一同观看公演舞台视频，通过不同视角进行讨论与解读，带领观众一同了解节目的台前幕后。

两年前，一个有钱人杨云昌找到了正为资金短缺而苦恼的阳光剧社，并主动为他们提供了新剧《最后离别》大剧场的公演资金，而唯一的条件，就是公演之前每天下午两点半到六点半四个小时时间里，全剧社成员要到城南一所空荡仓库中进行排演，中途谁也不许离席，然而就在公演前，杨云昌却突然失踪，原本计划的演出也泡了汤，大家失望至极剧社从此解散。两年后，剧社成员叶千继续撰写《最后离别》，然而自从叶千开始动笔，怪事便接二连三开始发生……