人类因谜般的现象而在一刹时石化，之后过了数千年——领有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。面临文明烧毁的石之世界（STONE WORLD），千空决意依靠科学的力量取回原本的世界。他齐集新的伙伴，创立了『科学王国』。火、铁、电气、玻璃、手机……千空等人首先跨越从石器时代到现代文明的200万年科学史。但堪称灵长类非常强的高中生·狮子王司所率领的『武力帝国』却阻挡在他们面前。以净化人类为目标的司，企图利用强大的武力来阻止科学的发展——STONE WARS，就此开火！而与此同时苏醒过来的有，以有着过人体力
